Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIPA1L1O43166 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIPA1L1O43166 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIPA1L1O43166 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIPA1L1O43166 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIPA1L1O43166 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIPA1L1O43166 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIPA1L1O43166 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIPA1L1O43166 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIPA1L1O43166 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIPA1L1O43166 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIPA1L1O43166 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIPA1L1O43166 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIPA1L1O43166 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.58■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIPA1L1O43166 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms