Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXN3O00409 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FOXN3O00409 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms