Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LH3BP13 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2LH3BP13 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms