Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO7DNF2Z398 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO7DNF2Z398 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO7DNF2Z398 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms