Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01549A6NIU2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms