Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GOLGA6CA6NDK9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6CA6NDK9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6CA6NDK9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms