Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PALM3A6NDB9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PALM3A6NDB9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PALM3A6NDB9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PALM3A6NDB9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms