Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCP2D1Q9UJQ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SCP2D1Q9UJQ7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms