Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSFQ9UBX1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSFQ9UBX1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms