Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DKK3Q9UBP4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK3Q9UBP4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms