Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM3

ITSN2, Intersectin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN2Q9NZM3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ITSN2Q9NZM3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ITSN2Q9NZM3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ITSN2Q9NZM3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ITSN2Q9NZM3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
ITSN2Q9NZM3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ITSN2Q9NZM3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms