Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZDHHC3Q9NYG2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZDHHC3Q9NYG2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms