Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9A5

CNOT10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT10Q9H9A5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT10Q9H9A5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT10Q9H9A5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT10Q9H9A5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT10Q9H9A5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.1 ms