Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NSD3Q9BZ95 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NSD3Q9BZ95 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NSD3Q9BZ95 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NSD3Q9BZ95 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NSD3Q9BZ95 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NSD3Q9BZ95 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NSD3Q9BZ95 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NSD3Q9BZ95 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms