Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW61

DDA1, DET1- and DDB1-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDA1Q9BW61 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDA1Q9BW61 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDA1Q9BW61 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDA1Q9BW61 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDA1Q9BW61 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDA1Q9BW61 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDA1Q9BW61 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms