Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDCD1Q96RS6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCD1Q96RS6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms