Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NEUROD6Q96NK8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEUROD6Q96NK8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms