Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCZQ96LD1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCZQ96LD1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms