Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM8Q96KF7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms