Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO6Q96DC7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO6Q96DC7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms