Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC47Q96A33 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC47Q96A33 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC47Q96A33 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms