Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKL1Q969V6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKL1Q969V6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
MKL1Q969V6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKL1Q969V6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKL1Q969V6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKL1Q969V6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKL1Q969V6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKL1Q969V6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKL1Q969V6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKL1Q969V6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKL1Q969V6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MKL1Q969V6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKL1Q969V6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms