Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BEST2Q8NFU1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BEST2Q8NFU1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms