Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4X5

AFAP1L2, Actin filament-associated protein 1-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFAP1L2Q8N4X5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AFAP1L2Q8N4X5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AFAP1L2Q8N4X5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFAP1L2Q8N4X5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AFAP1L2Q8N4X5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms