Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KSR1Q8IVT5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KSR1Q8IVT5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KSR1Q8IVT5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KSR1Q8IVT5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KSR1Q8IVT5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KSR1Q8IVT5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KSR1Q8IVT5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KSR1Q8IVT5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KSR1Q8IVT5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KSR1Q8IVT5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KSR1Q8IVT5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KSR1Q8IVT5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KSR1Q8IVT5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KSR1Q8IVT5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KSR1Q8IVT5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KSR1Q8IVT5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KSR1Q8IVT5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms