Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
UBE2R2Q712K3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2R2Q712K3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2R2Q712K3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms