Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM78BQ5VT40 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM78BQ5VT40 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms