Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms