Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SS18Q15532 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SS18Q15532 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SS18Q15532 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18Q15532 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18Q15532 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18Q15532 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18Q15532 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18Q15532 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18Q15532 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18Q15532 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18Q15532 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SS18Q15532 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SS18Q15532 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SS18Q15532 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SS18Q15532 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18Q15532 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18Q15532 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18Q15532 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18Q15532 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18Q15532 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18Q15532 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18Q15532 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18Q15532 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18Q15532 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18Q15532 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18Q15532 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18Q15532 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18Q15532 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18Q15532 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18Q15532 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18Q15532 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18Q15532 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18Q15532 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18Q15532 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18Q15532 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18Q15532 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18Q15532 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18Q15532 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18Q15532 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18Q15532 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18Q15532 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18Q15532 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SS18Q15532 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SS18Q15532 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SS18Q15532 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SS18Q15532 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SS18Q15532 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SS18Q15532 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SS18Q15532 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SS18Q15532 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SS18Q15532 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SS18Q15532 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SS18Q15532 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SS18Q15532 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SS18Q15532 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18Q15532 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18Q15532 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18Q15532 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18Q15532 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18Q15532 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18Q15532 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18Q15532 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18Q15532 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18Q15532 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18Q15532 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18Q15532 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18Q15532 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18Q15532 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18Q15532 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18Q15532 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SS18Q15532 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18Q15532 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18Q15532 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18Q15532 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18Q15532 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18Q15532 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18Q15532 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18Q15532 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18Q15532 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18Q15532 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18Q15532 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18Q15532 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18Q15532 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18Q15532 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18Q15532 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18Q15532 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18Q15532 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18Q15532 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18Q15532 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18Q15532 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18Q15532 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18Q15532 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18Q15532 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SS18Q15532 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SS18Q15532 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SS18Q15532 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SS18Q15532 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SS18Q15532 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18Q15532 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms