Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPRIN1Q14444 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPRIN1Q14444 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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