Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH18Q13634 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH18Q13634 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
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