Protein–RNA interactions for Protein: Q03390

VPS60, Vacuolar protein-sorting-associated protein 60, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS60Q03390 AAD15YOL165C 432 nt5.88□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 ECM33YBR078W 1290 nt5.88□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 UBP9YER098W 2265 nt5.88□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 COR1YBL045C 1374 nt5.88□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 SED4YCR067C 3198 nt5.88□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 YML018CYML018C 1182 nt5.87□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 DCI1YOR180C 816 nt5.87□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 YMR027WYMR027W 1413 nt5.87□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 OPI7YDR360W 435 nt5.86□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 LEM3YNL323W 1245 nt5.86□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 ERG7YHR072W 2196 nt5.86□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 GUP2YPL189W 1830 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 PAL1YDR348C 1500 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 ORC5YNL261W 1440 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 CDC4YFL009W 2340 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 PGA3YML125C 939 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 YOR111WYOR111W 699 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 YPR195CYPR195C 330 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 ATG12YBR217W 561 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 RIM15YFL033C 5313 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 RSC2YLR357W 2670 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 DED81YHR019C 1665 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 QDR1YIL120W 1692 nt5.85□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 MCH4YOL119C 1506 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 BUD14YAR014C 2130 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 YFL034WYFL034W 3222 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 GLT1YDL171C 6438 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 YJL107CYJL107C 1164 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 YNR048WYNR048W 1182 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 UBC4YBR082C 447 nt5.84□□□□□ -1.47
VPS60Q03390 GUF1YLR289W 1938 nt5.84□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 MPM1YJL066C 759 nt5.83□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 SFK1YKL051W 1062 nt5.83□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 SET5YHR207C 1581 nt5.82□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 RPA49YNL248C 1248 nt5.82□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 SOL1YNR034W 966 nt5.82□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 YOR024WYOR024W 324 nt5.82□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 SHE10YGL228W 1734 nt5.82□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 MMP1YLL061W 1752 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 STE7YDL159W 1548 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 XPT1YJR133W 630 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 CTR3YLR411W 726 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 YLR463CYLR463C 552 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 RPS19BYNL302C 435 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 QRI1YDL103C 1434 nt5.81□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 YHR182WYHR182W 2358 nt5.8□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 KIP2YPL155C 2121 nt5.8□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 GEP3YOR205C 1671 nt5.8□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.8□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 GPM3YOL056W 912 nt5.8□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 YPL041CYPL041C 624 nt5.8□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 MRK1YDL079C 1506 nt5.79□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.79□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 SCO1YBR037C 888 nt5.79□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 UGA1YGR019W 1416 nt5.79□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 YOR1YGR281W 4434 nt5.79□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 ELP2YGR200C 2367 nt5.79□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 GAA1YLR088W 1845 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 PUS1YPL212C 1635 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 AAD4YDL243C 990 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 MNS1YJR131W 1650 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 CTS1YLR286C 1689 nt5.78□□□□□ -1.48
VPS60Q03390 SHM1YBR263W 1473 nt5.77□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 NGL2YMR285C 1548 nt5.77□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 NOC4YPR144C 1659 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 RPT1YKL145W 1404 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 MGS1YNL218W 1764 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 SHO1YER118C 1104 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 GTO1YGR154C 1071 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 CDC11YJR076C 1248 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 UBA2YDR390C 1911 nt5.76□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 CUE2YKL090W 1332 nt5.75□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 PAN6YIL145C 930 nt5.75□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 YJL171CYJL171C 1191 nt5.75□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.75□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 ISU2YOR226C 471 nt5.75□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 CAF4YKR036C 1932 nt5.74□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.74□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 PMP3YDR276C 168 nt5.74□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 YFR035CYFR035C 345 nt5.74□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 SUA5YGL169W 1281 nt5.74□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 YPL136WYPL136W 369 nt5.74□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 TAH18YPR048W 1872 nt5.74□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 MSN2YMR037C 2115 nt5.74□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 ADE6YGR061C 4077 nt5.73□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 ULA1YPL003W 1389 nt5.73□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 TPS3YMR261C 3165 nt5.73□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 PIN2YOR104W 849 nt5.73□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 YTA6YPL074W 2265 nt5.73□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 MOG1YJR074W 657 nt5.72□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 VMA13YPR036W 1437 nt5.72□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 ARB1YER036C 1833 nt5.71□□□□□ -1.49
VPS60Q03390 DFG5YMR238W 1377 nt5.71□□□□□ -1.5
VPS60Q03390 SOG2YOR353C 2376 nt5.71□□□□□ -1.5
VPS60Q03390 TFC6YDR362C 2019 nt5.71□□□□□ -1.5
VPS60Q03390 YDR154CYDR154C 351 nt5.71□□□□□ -1.5
VPS60Q03390 NRM1YNR009W 750 nt5.71□□□□□ -1.5
VPS60Q03390 CKA2YOR061W 1020 nt5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 157.5 ms