Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCE1P61221 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ABCE1P61221 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms