Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AIF1P55008 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AIF1P55008 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AIF1P55008 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AIF1P55008 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AIF1P55008 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AIF1P55008 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AIF1P55008 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AIF1P55008 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AIF1P55008 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AIF1P55008 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AIF1P55008 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AIF1P55008 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AIF1P55008 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIF1P55008 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIF1P55008 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AIF1P55008 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIF1P55008 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIF1P55008 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIF1P55008 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIF1P55008 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIF1P55008 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AIF1P55008 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AIF1P55008 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AIF1P55008 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AIF1P55008 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AIF1P55008 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AIF1P55008 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AIF1P55008 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AIF1P55008 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AIF1P55008 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AIF1P55008 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AIF1P55008 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AIF1P55008 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AIF1P55008 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AIF1P55008 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AIF1P55008 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AIF1P55008 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AIF1P55008 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AIF1P55008 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AIF1P55008 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AIF1P55008 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AIF1P55008 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AIF1P55008 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AIF1P55008 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AIF1P55008 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AIF1P55008 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AIF1P55008 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AIF1P55008 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AIF1P55008 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AIF1P55008 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AIF1P55008 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AIF1P55008 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AIF1P55008 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AIF1P55008 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AIF1P55008 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AIF1P55008 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AIF1P55008 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AIF1P55008 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AIF1P55008 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AIF1P55008 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AIF1P55008 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AIF1P55008 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AIF1P55008 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AIF1P55008 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AIF1P55008 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AIF1P55008 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AIF1P55008 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AIF1P55008 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AIF1P55008 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AIF1P55008 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AIF1P55008 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AIF1P55008 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AIF1P55008 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AIF1P55008 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AIF1P55008 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AIF1P55008 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AIF1P55008 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AIF1P55008 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AIF1P55008 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AIF1P55008 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AIF1P55008 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AIF1P55008 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AIF1P55008 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AIF1P55008 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AIF1P55008 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AIF1P55008 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AIF1P55008 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AIF1P55008 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AIF1P55008 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AIF1P55008 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AIF1P55008 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AIF1P55008 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AIF1P55008 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AIF1P55008 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AIF1P55008 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AIF1P55008 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AIF1P55008 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AIF1P55008 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AIF1P55008 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms