Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLTCL1P53675 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLTCL1P53675 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLTCL1P53675 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLTCL1P53675 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLTCL1P53675 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLTCL1P53675 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLTCL1P53675 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CLTCL1P53675 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CLTCL1P53675 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CLTCL1P53675 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLTCL1P53675 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLTCL1P53675 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms