RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: P47057
SNX4, Sorting nexin-4, yeast
Predictions only
Length
423 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SNX4
P47057
MTQ1
YNL063W
945 nt
5.05
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
SOL1
YNR034W
966 nt
5.05
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
STP4
YDL048C
1473 nt
5.05
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
APL6
YGR261C
2430 nt
5.05
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
AMD1
YML035C
2433 nt
5.05
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
PCA1
YBR295W
3651 nt
5.04
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
HXT3
YDR345C
1704 nt
5.04
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
LDS1
YAL018C
978 nt
5.04
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
HOC1
YJR075W
1191 nt
5.04
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
MRPS16
YPL013C
366 nt
5.04
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
NUP116
YMR047C
3342 nt
5.04
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
CLF1
YLR117C
2064 nt
5.04
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
YMR027W
YMR027W
1413 nt
5.04
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
GIP2
YER054C
1647 nt
5.04
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
APM2
YHL019C
1818 nt
5.04
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
TDA7
YNL176C
1911 nt
5.03
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
CDC34
YDR054C
888 nt
5.03
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
ECM14
YHR132C
1293 nt
5.03
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
DJP1
YIR004W
1299 nt
5.03
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
LIA1
YJR070C
978 nt
5.03
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
MTW1
YAL034W-A
870 nt
5.03
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
MOT2
YER068W
1764 nt
5.03
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
DOA1
YKL213C
2148 nt
5.03
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
FOL1
YNL256W
2475 nt
5.03
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
MDM31
YHR194W
1740 nt
5.03
□□□□□ -1.6
SNX4
P47057
HFI1
YPL254W
1467 nt
5.02
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
LYS12
YIL094C
1116 nt
5.02
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
DRE2
YKR071C
1047 nt
5.02
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
HCR1
YLR192C
798 nt
5.02
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
HAP3
YBL021C
435 nt
5.02
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
MLC2
YPR188C
492 nt
5.02
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
TPS3
YMR261C
3165 nt
5.02
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
SMF3
YLR034C
1422 nt
5.02
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
CYS4
YGR155W
1524 nt
5.02
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
RAD59
YDL059C
717 nt
5.01
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
NPY1
YGL067W
1155 nt
5.01
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
SUP19
tS(UGA)E
82 nt
5.01
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
SUP17
tS(UGA)I
82 nt
5.01
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
SUP16
tS(UGA)P
82 nt
5.01
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
YHR212W-A
YHR212W-A
204 nt
5.01
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
ASF1
YJL115W
840 nt
5.01
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
YAR061W
YAR061W
204 nt
5.01
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
LDB7
YBL006C
543 nt
5.01
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
DOM34
YNL001W
1161 nt
5.01
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
PAL1
YDR348C
1500 nt
5.01
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
SLT2
YHR030C
1455 nt
5
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
HPC2
YBR215W
1878 nt
5
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
BIO3
YNR058W
1443 nt
5
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
PHB1
YGR132C
864 nt
5
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
FMO1
YHR176W
1299 nt
5
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
YML101C-A
YML101C-A
318 nt
5
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
YBL044W
YBL044W
369 nt
5
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
PUS4
YNL292W
1212 nt
5
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
TFC6
YDR362C
2019 nt
5
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
VHC1
YBR235W
3363 nt
5
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
MPH3
YJR160C
1809 nt
5
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
OPT1
YJL212C
2400 nt
4.99
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
RIM15
YFL033C
5313 nt
4.99
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
MSE1
YOL033W
1611 nt
4.99
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
YDL218W
YDL218W
954 nt
4.99
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
YGR016W
YGR016W
573 nt
4.99
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
DCI1
YOR180C
816 nt
4.99
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
CAF4
YKR036C
1932 nt
4.99
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
DAK1
YML070W
1755 nt
4.99
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
SED4
YCR067C
3198 nt
4.98
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
GLC8
YMR311C
690 nt
4.98
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
TGS1
YPL157W
948 nt
4.98
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
DEF1
YKL054C
2217 nt
4.98
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
YML082W
YML082W
1950 nt
4.98
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
GAS3
YMR215W
1575 nt
4.97
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
SEC20
YDR498C
1152 nt
4.97
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
CDC21
YOR074C
915 nt
4.97
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
CRH1
YGR189C
1524 nt
4.97
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
RAT1
YOR048C
3021 nt
4.97
□□□□□ -1.61
SNX4
P47057
GCS1
YDL226C
1059 nt
4.96
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
snR10
snR10
245 nt
4.96
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
LSC1
YOR142W
990 nt
4.96
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
SHM1
YBR263W
1473 nt
4.95
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
YDR034W-B
YDR034W-B
156 nt
4.95
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
MRPL35
YDR322W
1104 nt
4.95
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
RPL34A
YER056C-A
366 nt
4.95
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
PCT1
YGR202C
1275 nt
4.95
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
AAT2
YLR027C
1257 nt
4.95
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
YMR122C
YMR122C
375 nt
4.95
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
YOR111W
YOR111W
699 nt
4.95
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
GAL4
YPL248C
2646 nt
4.95
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
GLT1
YDL171C
6438 nt
4.95
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
BRF1
YGR246C
1791 nt
4.94
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
TAF9
YMR236W
474 nt
4.94
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
MBP1
YDL056W
2502 nt
4.94
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
YDR109C
YDR109C
2148 nt
4.94
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
ABF1
YKL112W
2196 nt
4.94
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
MCH4
YOL119C
1506 nt
4.93
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
YER010C
YER010C
705 nt
4.93
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
UGA1
YGR019W
1416 nt
4.93
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
DBF2
YGR092W
1719 nt
4.93
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
ATG7
YHR171W
1893 nt
4.93
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
OM45
YIL136W
1182 nt
4.93
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
FMP33
YJL161W
543 nt
4.93
□□□□□ -1.62
SNX4
P47057
MHT1
YLL062C
975 nt
4.93
□□□□□ -1.62
First
Previous
20
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.2 ms