Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIA3P42263 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.3 ms