Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNFP41002 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNFP41002 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNFP41002 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNFP41002 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNFP41002 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNFP41002 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNFP41002 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNFP41002 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNFP41002 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNFP41002 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNFP41002 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNFP41002 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNFP41002 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNFP41002 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNFP41002 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNFP41002 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNFP41002 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNFP41002 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNFP41002 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNFP41002 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNFP41002 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNFP41002 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNFP41002 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNFP41002 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNFP41002 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNFP41002 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNFP41002 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNFP41002 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNFP41002 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNFP41002 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNFP41002 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNFP41002 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNFP41002 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNFP41002 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNFP41002 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNFP41002 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNFP41002 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNFP41002 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNFP41002 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNFP41002 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNFP41002 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNFP41002 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNFP41002 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNFP41002 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNFP41002 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNFP41002 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNFP41002 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNFP41002 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNFP41002 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNFP41002 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNFP41002 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNFP41002 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNFP41002 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNFP41002 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNFP41002 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNFP41002 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNFP41002 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNFP41002 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCNFP41002 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNFP41002 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNFP41002 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNFP41002 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNFP41002 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNFP41002 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNFP41002 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNFP41002 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNFP41002 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNFP41002 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNFP41002 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNFP41002 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNFP41002 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNFP41002 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNFP41002 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNFP41002 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNFP41002 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNFP41002 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNFP41002 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNFP41002 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNFP41002 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNFP41002 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNFP41002 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNFP41002 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNFP41002 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNFP41002 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNFP41002 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNFP41002 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNFP41002 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNFP41002 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNFP41002 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNFP41002 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNFP41002 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNFP41002 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNFP41002 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNFP41002 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNFP41002 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNFP41002 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNFP41002 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNFP41002 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNFP41002 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms