Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFX1P22670 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFX1P22670 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFX1P22670 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFX1P22670 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFX1P22670 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFX1P22670 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX1P22670 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX1P22670 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX1P22670 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX1P22670 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX1P22670 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX1P22670 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX1P22670 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX1P22670 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX1P22670 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX1P22670 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX1P22670 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX1P22670 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX1P22670 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX1P22670 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX1P22670 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX1P22670 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX1P22670 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX1P22670 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX1P22670 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX1P22670 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX1P22670 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX1P22670 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX1P22670 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX1P22670 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX1P22670 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX1P22670 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX1P22670 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX1P22670 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX1P22670 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX1P22670 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX1P22670 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX1P22670 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX1P22670 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX1P22670 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX1P22670 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX1P22670 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX1P22670 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX1P22670 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX1P22670 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX1P22670 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX1P22670 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX1P22670 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX1P22670 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX1P22670 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX1P22670 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX1P22670 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX1P22670 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX1P22670 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX1P22670 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX1P22670 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX1P22670 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX1P22670 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX1P22670 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX1P22670 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RFX1P22670 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFX1P22670 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RFX1P22670 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RFX1P22670 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFX1P22670 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFX1P22670 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX1P22670 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX1P22670 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX1P22670 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX1P22670 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX1P22670 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX1P22670 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX1P22670 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX1P22670 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX1P22670 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX1P22670 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX1P22670 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX1P22670 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX1P22670 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX1P22670 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX1P22670 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX1P22670 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX1P22670 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX1P22670 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX1P22670 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX1P22670 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX1P22670 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX1P22670 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX1P22670 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX1P22670 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX1P22670 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX1P22670 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX1P22670 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX1P22670 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX1P22670 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX1P22670 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX1P22670 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX1P22670 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX1P22670 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.9 ms