Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCKDHBP21953 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BCKDHBP21953 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCKDHBP21953 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCKDHBP21953 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCKDHBP21953 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCKDHBP21953 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCKDHBP21953 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCKDHBP21953 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCKDHBP21953 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCKDHBP21953 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCKDHBP21953 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCKDHBP21953 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCKDHBP21953 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCKDHBP21953 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCKDHBP21953 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BCKDHBP21953 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BCKDHBP21953 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BCKDHBP21953 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCKDHBP21953 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCKDHBP21953 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms