Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NELFEP18615 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NELFEP18615 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NELFEP18615 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NELFEP18615 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NELFEP18615 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NELFEP18615 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NELFEP18615 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NELFEP18615 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NELFEP18615 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NELFEP18615 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NELFEP18615 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NELFEP18615 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NELFEP18615 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NELFEP18615 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NELFEP18615 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NELFEP18615 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NELFEP18615 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NELFEP18615 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NELFEP18615 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NELFEP18615 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NELFEP18615 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NELFEP18615 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NELFEP18615 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NELFEP18615 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NELFEP18615 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NELFEP18615 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NELFEP18615 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NELFEP18615 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NELFEP18615 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NELFEP18615 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NELFEP18615 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NELFEP18615 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NELFEP18615 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NELFEP18615 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NELFEP18615 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NELFEP18615 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NELFEP18615 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NELFEP18615 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NELFEP18615 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NELFEP18615 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NELFEP18615 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NELFEP18615 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NELFEP18615 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NELFEP18615 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NELFEP18615 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NELFEP18615 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NELFEP18615 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NELFEP18615 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NELFEP18615 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NELFEP18615 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NELFEP18615 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NELFEP18615 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NELFEP18615 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NELFEP18615 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NELFEP18615 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NELFEP18615 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NELFEP18615 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NELFEP18615 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NELFEP18615 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NELFEP18615 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NELFEP18615 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NELFEP18615 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NELFEP18615 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NELFEP18615 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NELFEP18615 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NELFEP18615 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NELFEP18615 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NELFEP18615 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NELFEP18615 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NELFEP18615 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NELFEP18615 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NELFEP18615 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NELFEP18615 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NELFEP18615 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NELFEP18615 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NELFEP18615 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NELFEP18615 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NELFEP18615 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NELFEP18615 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NELFEP18615 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NELFEP18615 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NELFEP18615 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NELFEP18615 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NELFEP18615 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NELFEP18615 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NELFEP18615 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NELFEP18615 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NELFEP18615 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NELFEP18615 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NELFEP18615 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NELFEP18615 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NELFEP18615 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NELFEP18615 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NELFEP18615 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NELFEP18615 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NELFEP18615 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NELFEP18615 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NELFEP18615 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NELFEP18615 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms