Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF28P17035 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms