Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC2P0DI81 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC2P0DI81 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2P0DI81 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2P0DI81 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2P0DI81 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2P0DI81 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2P0DI81 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms