Protein–RNA interactions for Protein: O75530

EED, Polycomb protein EED, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEDO75530 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEDO75530 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEDO75530 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EEDO75530 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EEDO75530 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EEDO75530 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EEDO75530 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EEDO75530 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EEDO75530 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EEDO75530 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EEDO75530 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EEDO75530 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EEDO75530 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EEDO75530 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EEDO75530 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EEDO75530 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEDO75530 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEDO75530 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEDO75530 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEDO75530 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEDO75530 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEDO75530 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EEDO75530 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EEDO75530 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEDO75530 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEDO75530 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEDO75530 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEDO75530 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEDO75530 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EEDO75530 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EEDO75530 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EEDO75530 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EEDO75530 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EEDO75530 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EEDO75530 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EEDO75530 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EEDO75530 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEDO75530 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEDO75530 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEDO75530 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEDO75530 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEDO75530 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEDO75530 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EEDO75530 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEDO75530 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEDO75530 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EEDO75530 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEDO75530 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEDO75530 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEDO75530 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEDO75530 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEDO75530 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEDO75530 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEDO75530 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEDO75530 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEDO75530 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEDO75530 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEDO75530 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEDO75530 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EEDO75530 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEDO75530 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEDO75530 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEDO75530 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEDO75530 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEDO75530 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEDO75530 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEDO75530 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EEDO75530 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEDO75530 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEDO75530 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEDO75530 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEDO75530 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEDO75530 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEDO75530 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEDO75530 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEDO75530 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEDO75530 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEDO75530 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEDO75530 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEDO75530 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEDO75530 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEDO75530 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEDO75530 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEDO75530 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEDO75530 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEDO75530 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EEDO75530 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EEDO75530 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEDO75530 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEDO75530 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EEDO75530 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEDO75530 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEDO75530 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEDO75530 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEDO75530 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEDO75530 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEDO75530 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEDO75530 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEDO75530 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEDO75530 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 390.4 ms