Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
H3BQV1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
H3BQV1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
H3BQV1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
H3BQV1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
H3BQV1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
H3BQV1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
H3BQV1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
H3BQV1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
H3BQV1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
H3BQV1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
H3BQV1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
H3BQV1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
H3BQV1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
H3BQV1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
H3BQV1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
H3BQV1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
H3BQV1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
H3BQV1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
H3BQV1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
H3BQV1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
H3BQV1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
H3BQV1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
H3BQV1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
H3BQV1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
H3BQV1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
H3BQV1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
H3BQV1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
H3BQV1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
H3BQV1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
H3BQV1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
H3BQV1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
H3BQV1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
H3BQV1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
H3BQV1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
H3BQV1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
H3BQV1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
H3BQV1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
H3BQV1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H3BQV1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
H3BQV1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H3BQV1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
H3BQV1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H3BQV1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
H3BQV1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
H3BQV1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
H3BQV1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
H3BQV1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
H3BQV1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
H3BQV1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
H3BQV1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
H3BQV1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
H3BQV1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
H3BQV1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
H3BQV1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
H3BQV1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
H3BQV1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
H3BQV1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
H3BQV1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
H3BQV1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
H3BQV1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
H3BQV1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H3BQV1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H3BQV1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
H3BQV1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
H3BQV1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H3BQV1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H3BQV1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
H3BQV1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H3BQV1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
H3BQV1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
H3BQV1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
H3BQV1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
H3BQV1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
H3BQV1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
H3BQV1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
H3BQV1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
H3BQV1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
H3BQV1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
H3BQV1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
H3BQV1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
H3BQV1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
H3BQV1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
H3BQV1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
H3BQV1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H3BQV1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H3BQV1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H3BQV1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
H3BQV1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
H3BQV1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H3BQV1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H3BQV1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
H3BQV1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
H3BQV1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
H3BQV1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
H3BQV1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
H3BQV1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
H3BQV1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
H3BQV1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H3BQV1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms