Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM227AF5H4B4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM227AF5H4B4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms