Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 DST-217ENST00000518398 1778 ntTSL 1 (best)5.57□□□□□ -1.523e-6■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 YWHAQ-204ENST00000460093 345 ntTSL 24.97□□□□□ -1.613e-6■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 SLC26A6-215ENST00000466257 706 ntTSL 38.26□□□□□ -1.092e-9■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 DCXR-213ENST00000580320 915 ntTSL 220.84■□□□□ 0.932e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 DCXR-221ENST00000585164 475 ntTSL 520.71■□□□□ 0.912e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 DCXR-206ENST00000578273 877 ntTSL 520.57■□□□□ 0.882e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 DCXR-210ENST00000579334 1251 ntTSL 520.29■□□□□ 0.842e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 DCXR-207ENST00000578885 968 ntTSL 520.06■□□□□ 0.82e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 DCXR-214ENST00000580750 1076 ntTSL 519.86■□□□□ 0.772e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.762e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 DCXR-218ENST00000582900 676 ntTSL 319.26■□□□□ 0.672e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 DCXR-215ENST00000581584 766 ntTSL 318.67■□□□□ 0.582e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 DCXR-209ENST00000579155 430 ntTSL 517.36■□□□□ 0.372e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.332e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 LAMA5-208ENST00000474128 579 ntTSL 316.47■□□□□ 0.232e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 DCXR-204ENST00000577712 429 ntTSL 514.54□□□□□ -0.082e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 LENG8-AS1-203ENST00000448978 464 ntTSL 511.14□□□□□ -0.632e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 LENG8-AS1-202ENST00000429922 871 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.952e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.363e-6■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 CYBA-205ENST00000565588 221 ntTSL 210.47□□□□□ -0.737e-12■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 LPCAT1-203ENST00000503252 2694 ntTSL 219.4■□□□□ 0.74e-11■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 ZMYND8-208ENST00000435836 670 ntTSL 58.4□□□□□ -1.064e-11■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 ZMYND8-210ENST00000446894 341 ntTSL 24.35□□□□□ -1.714e-11■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 ZMYND8-209ENST00000441977 175 ntTSL 30.33□□□□□ -2.364e-11■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.751e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 PPP2CA-201ENST00000231504 564 ntTSL 425.44■■□□□ 1.661e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.61e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.111e-39■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.811e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 EIF4G1-226ENST00000450424 2658 ntTSL 519.37■□□□□ 0.691e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.591e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 PSMG1-203ENST00000411828 959 ntTSL 318.67■□□□□ 0.581e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 EIF4G1-237ENST00000485712 474 ntTSL 417.94■□□□□ 0.461e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 EIF4G1-210ENST00000421110 2755 ntTSL 517.51■□□□□ 0.391e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 PSMG1-204ENST00000431628 760 ntTSL 1 (best)16.4■□□□□ 0.221e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.191e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 758 ntTSL 514.64□□□□□ -0.071e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 OBSL1-206ENST00000462385 951 ntTSL 213.41□□□□□ -0.261e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 EIF4G1-227ENST00000455679 542 ntTSL 412.97□□□□□ -0.331e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 NEDD8-MDP1-203ENST00000604306 681 ntTSL 512.44□□□□□ -0.421e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 NEDD8-208ENST00000560427 654 ntTSL 212.41□□□□□ -0.421e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 EIF4G1-214ENST00000427141 730 ntTSL 511.88□□□□□ -0.511e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 EIF4G1-220ENST00000440448 578 ntTSL 410.52□□□□□ -0.731e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 EIF4G1-223ENST00000444134 558 ntTSL 510.4□□□□□ -0.741e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 NEDD8-204ENST00000526430 286 ntTSL 310.32□□□□□ -0.761e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 NEDD8-205ENST00000527046 847 ntTSL 210.32□□□□□ -0.761e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 NEDD8-202ENST00000396828 626 ntTSL 29.9□□□□□ -0.821e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.881e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 NEDD8-206ENST00000531430 651 ntTSL 28.77□□□□□ -1.011e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 471 ntTSL 28.35□□□□□ -1.071e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 AC104109.4-201ENST00000520515 1744 ntTSL 27.1□□□□□ -1.271e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.31e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.421e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 DDB1-220ENST00000542337 558 ntTSL 319.33■□□□□ 0.683e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.113e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 DDB1-223ENST00000543658 571 ntTSL 411.6□□□□□ -0.553e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 DDB1-221ENST00000543162 575 ntTSL 410.53□□□□□ -0.723e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 DDB1-222ENST00000543627 540 ntTSL 510.5□□□□□ -0.733e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 DDB1-214ENST00000539426 805 ntTSL 310.31□□□□□ -0.763e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 DDB1-217ENST00000540166 3906 ntTSL 28.98□□□□□ -0.973e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 DDB1-208ENST00000537120 1215 ntTSL 28.01□□□□□ -1.133e-7■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.815e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 RSL1D1-209ENST00000573618 710 ntTSL 58.56□□□□□ -1.045e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 RSL1D1-202ENST00000396503 1470 ntTSL 27.74□□□□□ -1.175e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 PAH-213ENST00000551988 584 ntTSL 37.58□□□□□ -1.25e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 RSL1D1-201ENST00000355674 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.26□□□□□ -1.255e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 RSL1D1-207ENST00000573029 766 ntTSL 36□□□□□ -1.455e-8■□□□□ 8.7
PRPF4O43172 ZSCAN5A-216ENST00000592679 923 ntTSL 220.35■□□□□ 0.853e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.133e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZSCAN5A-215ENST00000592509 589 ntTSL 213.59□□□□□ -0.233e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZSCAN5A-205ENST00000587340 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.483e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZSCAN5A-212ENST00000591078 686 ntTSL 311.13□□□□□ -0.633e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZSCAN5A-217ENST00000593106 849 ntTSL 510.11□□□□□ -0.793e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZSCAN5A-202ENST00000585670 314 ntTSL 38.98□□□□□ -0.973e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZSCAN5A-210ENST00000589279 686 ntTSL 28.89□□□□□ -0.993e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZSCAN5A-207ENST00000587614 589 ntTSL 47.45□□□□□ -1.223e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZSCAN5A-208ENST00000588442 576 ntTSL 47.25□□□□□ -1.253e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 MORF4L2-213ENST00000488331 326 ntTSL 25.79□□□□□ -1.489e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.132e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 HPN-209ENST00000600675 551 ntTSL 421.82■■□□□ 1.082e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.912e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.912e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZNF331-212ENST00000509069 461 ntTSL 319■□□□□ 0.632e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SH3BP2-220ENST00000511663 966 ntTSL 518.41■□□□□ 0.542e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ATXN7L3-207ENST00000589805 622 ntTSL 318.22■□□□□ 0.512e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.482e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SH3BP2-218ENST00000511185 1071 ntTSL 217.71■□□□□ 0.432e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 POR-212ENST00000447222 2332 ntTSL 517.53■□□□□ 0.42e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 LZTR1-214ENST00000492480 695 ntTSL 317.42■□□□□ 0.383e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 POR-216ENST00000454934 2295 ntTSL 317.4■□□□□ 0.382e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SH3BP2-214ENST00000509677 1087 ntTSL 317.28■□□□□ 0.362e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.32e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 POR-219ENST00000471238 600 ntTSL 316.69■□□□□ 0.262e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SH3BP2-223ENST00000512131 615 ntTSL 216.38■□□□□ 0.212e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.218e-14■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UNK-208ENST00000592629 633 ntTSL 316.34■□□□□ 0.212e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.192e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 POR-213ENST00000448410 1104 ntTSL 315.51■□□□□ 0.072e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SH3BP2-206ENST00000503219 551 ntTSL 415.24■□□□□ 0.032e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZNF331-206ENST00000504033 578 ntTSL 515.23■□□□□ 0.032e-6■□□□□ 8.6
Retrieved 100 of 20,551 protein–RNA pairs in 390.8 ms