RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.36■■□□□ 1.81
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABCC9O60706 1549 aa24.89■■□□□ 1.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.87■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.19■■□□□ 1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NACADO15069 1562 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCRIBQ14160 1630 aa21.9■■□□□ 1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CUX2O14529 1486 aa21.63■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERCC6Q03468 1493 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM41Q8WV44 630 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NESP48681 1621 aa21.15■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NCAPD3P42695 1498 aa21.11■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.97■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMARCA2P51531 1590 aa20.9■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HMGXB3Q12766 1538 aa20.83■□□□□ 0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.75■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMARCA4P51532 1647 aa20.72■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OSCARQ8IYS5 282 aa20.65■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDR62O43379 1518 aa20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.39■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.39■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.39■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGEF11O15085 1522 aa20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WIZO95785 1651 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CFTRP13569 1480 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARAP1Q96P48 1450 aa20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBLN2P98095 1184 aa19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFT140Q96RY7 1462 aa19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHD1O14646 1710 aa19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.82■□□□□ 0.768e-8■■□□□ 11.9
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TOPBP1Q92547 1522 aa19.77■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRDM2Q13029 1718 aa19.65■□□□□ 0.74
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABCC8Q09428 1581 aa19.61■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYNJ1O43426 1573 aa19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SOGA1O94964 1423 aa19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYNJ2O15056 1496 aa19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRIN2BQ13224 1484 aa19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.32■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.31■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa19.28■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDR97A6NE52 1622 aa19.25■□□□□ 0.67
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF13AQ9H1H9 1805 aa19.2■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CUX1P39880 1505 aa19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PBRM1Q86U86 1689 aa19.16■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEP170Q5SW79 1584 aa19.15■□□□□ 0.66
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRIN2AQ12879 1464 aa19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.05■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABCC10Q5T3U5 1492 aa19.04■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KDM6BO15054 1643 aa19.03■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUP160Q12769 1436 aa19.02■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.99■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SHROOM2Q13796 1616 aa18.98■□□□□ 0.63
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 JPH4Q96JJ6 628 aa18.95■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADAMTS12P58397 1594 aa18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms