Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYQ6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYQ6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYQ6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYQ6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYQ6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYQ6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYQ6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYQ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYQ6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYQ6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYQ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYQ6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
V9GYQ6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYQ6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYQ6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYQ6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYQ6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYQ6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYQ6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYQ6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYQ6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYQ6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYQ6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYQ6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYQ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYQ6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYQ6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYQ6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYQ6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYQ6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYQ6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYQ6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYQ6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYQ6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYQ6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
V9GYQ6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
V9GYQ6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
V9GYQ6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
V9GYQ6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
V9GYQ6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYQ6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYQ6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYQ6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYQ6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYQ6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYQ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYQ6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYQ6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYQ6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYQ6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYQ6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYQ6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GYQ6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GYQ6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GYQ6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GYQ6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GYQ6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GYQ6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GYQ6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GYQ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GYQ6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GYQ6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GYQ6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GYQ6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GYQ6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GYQ6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GYQ6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GYQ6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GYQ6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GYQ6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GYQ6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GYQ6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GYQ6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GYQ6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GYQ6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GYQ6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GYQ6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GYQ6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
V9GYQ6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GYQ6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GYQ6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GYQ6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GYQ6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GYQ6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GYQ6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GYQ6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GYQ6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GYQ6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GYQ6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GYQ6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GYQ6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GYQ6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GYQ6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GYQ6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GYQ6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GYQ6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GYQ6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GYQ6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GYQ6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms