Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
A3GALT2U3KPV4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
A3GALT2U3KPV4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
A3GALT2U3KPV4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
A3GALT2U3KPV4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
A3GALT2U3KPV4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
A3GALT2U3KPV4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
A3GALT2U3KPV4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
A3GALT2U3KPV4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
A3GALT2U3KPV4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
A3GALT2U3KPV4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
A3GALT2U3KPV4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
A3GALT2U3KPV4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
A3GALT2U3KPV4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms